基于16S rRNA序列对4种扇贝4个群体亲缘关系分析
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相明玥(1996-),女,本科生,研究方向为水产生物技术,786884040@qq.com

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国家级大学生创新训练项目(201610158041);辽宁省重点研发计划指导计划项目(2017203003)


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     大连市场上出现一种与栉孔扇贝(Chlamys farreri)形态结构相似的扇贝,被人们俗称为“俄罗斯栉孔扇贝”。为了探究其与3种常见扇贝的亲缘关系,本研究利用16S rRNA基因序列,将“俄罗斯栉孔扇贝”分别与中国地区的栉孔扇贝(Chlamys farreri)、海湾扇贝(Argopecten irradians)、虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)以及美国大西洋地区的海湾扇贝(Argopecten irradians)和日本地区的虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)等不同地区群体的扇贝进行遗传学对比分析,并结合GenBank中其他双壳贝类16S rRNA序列分析碱基组成,计算种间遗传距离,构建系统发育树,明确该扇贝的分类地位。结果显示:4种碱基(A、T、G、C)各自的含量较为接近,且这4种扇贝的基因片段中,A+T的含量均高于G+C的含量,这与其他贝类16S rRNA基因片段的研究结果相一致。16S rRNA(长牡蛎为外群)的双壳贝类系统发育树分析显示,与该扇贝亲缘关系由近及远分别是虾夷扇贝、栉孔扇贝、赭类栉孔扇贝、华贵栉孔扇贝、海扇贝、海湾扇贝和长牡蛎。该扇贝与虾夷扇贝遗传距离最近(0.073),且其与栉孔扇贝遗传距离已达到种间差异水平。序列对比结果说明该“俄罗斯栉孔扇贝”是岛扇贝(Chlamys islandica)。本研究将为在分子水平上了解不同地区的4种扇贝群体遗传背景提供信息。[中国渔业质量与标准,2018,8(3):68-74]

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引用本文

相明玥,曾令坤,李祯,等.基于16S rRNA序列对4种扇贝4个群体亲缘关系分析[J].中国渔业质量与标准,2018,8(3):68-74.[J]. Chinese Fishery Quality and Standards,2018,8(3):68-74.

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  • 最后修改日期:2018-06-28
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